Управление МБОУШР "Гимназия" осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации, Уставом образовательной организации, строится на принципах единоначалия и коллегиальности. Единоличным исполнительным органом школы является директор, который осуществляет текущее руководство её деятельностью.
Коллегиальными органами управления Гимназии являются следующие сообщества.
Общее собрание работников. В его состав входят все работники учреждения. Руководство деятельностью Общего собрания работников осуществляет директор.
Педагогический совет. В состав Педагогического совета входят: диретор, заместители директора, иные руководящие работники, педагоги, работники библиотеки. Заседания Педагогического совета проводятся в соответствии с планом работы учреждения, но не реже четырех раз в течение учебного года.
Управляющий совет. Формируется посредством процедур выбора и назначения. Решения Управляющего Совета, принятые в пределах его полномочий, являются обязательными для всех участников образовательного процесса.
Ученический парламент. Формируется из числа избранных мэров 5-11 классов. Парламент представляет интересы обучающихся.